Родился в многодетной дворянской семье потомственного моряка, адмирала русского флота.
В 1856 г. зачислен кандидатом в петербургский Пажеский корпус.
В ноябре 1857 г. по просьбе отца переведен в Морской кадетский корпус, где учился до 1860 г.
В октябре 1860 г. ушел в трехгодичное кругосветное плавание, на корвете "Калевала", о котором в 1895 г. рассказал в повести "Вокруг света на "Коршуне".
В 1864 г. мичман 11 флотского экипажа Станюкович решил бросить морскую службу и вышел в отставку с производством в чин лейтенанта.
Летом 1869 г. поступил на службу в управление Курско-Харьковско-Азовской железной дороги и проживал в Курске.
В Курске и на местных впечатлениях им написана пьеса "На то и щука в море, чтобы карась не дремал" (1871). Пьеса запретили накануне представления по особому ходатайству железнодорожных дельцов. Позднее — роман "Равнодушные" (1899).
В курский период жизни у писателя оформилась стойкая ненависть к буржуазным правопорядкам, утверждавшимся в России, и вместе с тем окрепли демократические, народнические настроения.
1871 г. служит в Петербургском Обществе взаимного поземельного кредита.
С 1873 г. — управляющий пароходством по реке Дон и Азовскому морю в г. Ростов-на-Дону.
В 1870-х гг. после опубликования в журнале "Дело" нескольких рассказов и романов Станюкович приобрел широкую литературную известность.
В 1881 г., после смерти редактора журнала "Дела" Благосветлова, Станюкович вместе с Шелгуновым и Бажиным становится соредактором.
В декабре 1883 г. приобретает журнал в собственность.
В 1902 г. Станюкович с сильным мозговым переутомлением и общим нервным расстройством уехал в Италию.
Скончался и похоронен в Неаполе.
Станюкович — автор произведений:
"Из кругосветного плаванья" (1867; сборник очерков о жизни моряков),
"На то щука в море, чтобы карась не дремал", (1871);
"Письма знатных иностранцев",
"Картинки общественной жизни",
"Без исхода" (1871-1872; первый роман),
"Похождения одного благонамеренного молодого человека, рассказанные им самим" (1879),
"Два брата" (1880; роман; впервые - в журнале "Дело"),
"Благотворительная комедия" (1880; рассказ),
"Омут" (1881; роман),
"Беглец" (1886; первый рассказ из серии "Морские рассказы"; впервые - в журнале "Северный вестник" под псевдонимом М.Костин),
"Василий Иванович" (1886; первая повесть из серии "Морские рассказы"; впервые - в журнале "Вестник Европы"),
"Морские рассказы" (1886-1902),
"В далекие края" (1886; впервые - в журнале "Русская мысль"),
"Бесшабашный" (1891),
"Пассажирка" (1892; впервые - в газете "Русские ведомости"),
"Маленькие моряки" (1893; автобиографическая повесть),
"Беспокойный адмирал" (1894; повесть),
"Вокруг света на "Коршуне" (1895; повесть),
"Жрецы" (1897; роман),
"История одной жизни" (1895; роман; впервые - в журнале "Мир божий"),
"Матроска" (1895; впервые - в газете "Русские ведомости"),
"Шутка" (1898),
"Утро" (1901),
"Собака" (1902),
"Берег" и море" (1902),
"Севастопольский мальчик" (1902; повесть; впервые - в журнале "Юный читатель"),
"Откровенные",
"Равнодушные",
"Похождения одного матроса",
"Женитьба Пинегина",
"Червонный валет" (повесть),
"Наши нравы" (роман),
"В мутной воде" (роман),
"В места не столь отдаленные" (роман).
И. З. Баскевич